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         蛋白質(zhì)乙?;揎椨梢阴;D(zhuǎn)移酶和去乙?;腹餐{(diào)節(jié),通過感應代謝環(huán)境變化而變化,同時其常在代謝酶上發(fā)生修飾,進而調(diào)控代謝通路及代謝酶的活性,參與下游代謝物變化。蛋白質(zhì)乙酰化(acetylation)是最常見的酰化修飾類型,是指在乙?;D(zhuǎn)移酶的催化下把乙酰基團(如乙酰輔酶A等供體)共價結合到底物蛋白質(zhì)的賴氨酸殘基上的過程,主要發(fā)生在蛋白質(zhì)賴氨酸殘基的ε-NH2位,其分子質(zhì)量會相應增加42.01Da,質(zhì)譜能夠準確地測定分子量是否發(fā)生相應的質(zhì)量偏移,實現(xiàn)酰化修飾肽段及位點的分析。 4D-label free乙酰化修飾蛋白組學是基于timsTOF Pro質(zhì)譜儀,通過數(shù)據(jù)依賴性采集-同步累積連續(xù)碎裂(ddaPASEF)掃描模式進行乙?;町惖鞍踪|(zhì)組學分析。4D-label free修飾組,利用了離子淌度分離,能根據(jù)分子的形狀、截面積屬性,可有效區(qū)分修飾同分異構多肽,極大提高修飾的鑒定深度,以更少上樣量、更快掃描速度,實現(xiàn)蛋白質(zhì)組學在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

    技術路線

    技術優(yōu)勢

    1. 4D技術加持,提高定量的準確性、鑒定深度,更加適合微量樣本;

    2. 克服標記定量蛋白質(zhì)組學技術在樣本數(shù)量上的限制,靈活方便;

    3. 基于質(zhì)譜平臺(Bruker timsTOF pro),檢測速度提升近一倍;

    4. 經(jīng)驗豐富——超18年蛋白平臺服務經(jīng)驗,擁有豐富的高水平項目文章;

    5. 數(shù)據(jù)保證——采用進口金標抗體,數(shù)據(jù)結果穩(wěn)定可靠;

    6. 系統(tǒng)解決方案——提供修飾組學至驗證、上下游聯(lián)合分析,實現(xiàn)快捷”一站式”服務。

    數(shù)據(jù)分析

    1、標準數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

    鑒定分析:鑒定與定量結果統(tǒng)計;單個樣本蛋白質(zhì)鑒定結果統(tǒng)計;韋恩圖。

    表達差異分析:差異結果統(tǒng)計;差異結果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

    多組的比較分析(組別>=3):mufzz聚類;雷達圖;箱線圖。

    功能分析:亞細胞定位;結構域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網(wǎng)絡分析。

    質(zhì)量控制分析:肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布。

    2、高級數(shù)據(jù)分析

    功能分析:GSEA富集分析。

    臨床藥物研究:藥物靶點注釋。

    標志物篩選:集成機器學習。

    與臨床表征的聯(lián)合分析:熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

    推薦組合產(chǎn)品

    打通表型-機制研究:乙?;M+代謝組。

    推薦應用領域

    能量代謝調(diào)控;

    代謝綜合征研究;

    真菌細菌研究。

    樣品要求

    項目案列
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