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    項目介紹

         代謝組學(xué)可以研究某一生物、組織或細(xì)胞在特定環(huán)境下的特定時期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物。相比其他組學(xué),代謝組與表型有著更近的聯(lián)系。蛋白組和代謝組緊密聯(lián)系,蛋白水平會影響代謝產(chǎn)物的表達(dá)譜,而代謝物濃度又會影響蛋白表達(dá)量。代謝組學(xué)分析可以幫助蛋白組數(shù)據(jù)在功能上進(jìn)行解釋;而蛋白質(zhì)組學(xué)分析通過突出參與的酶或酶促途徑,有助于更好地理解代謝組學(xué)數(shù)據(jù)。蛋白組學(xué)與代謝組學(xué)整合分析能夠更好地解釋疾病或外界刺激的分子機(jī)理和不同組學(xué)對通路的調(diào)控機(jī)制,更直觀地了解代謝物、酶及基因之間上下游的調(diào)控關(guān)系。

    分析方法

          篩選出差異表達(dá)的蛋白和代謝小分子,基于O2PLS關(guān)聯(lián)分析進(jìn)行多變量整合分析。對差異蛋白與差異代謝小分子進(jìn)行斯皮爾曼(Spearman)相關(guān)性分析,并進(jìn)一步構(gòu)建相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)。然后,將差異蛋白和差異代謝小分子映射到iPath 整體代謝通路和KEGG 通路上,并進(jìn)行KEGG 富集分析。最后,利用Cytoscape 中的Metscape 插件進(jìn)行蛋白組和代謝組的互作網(wǎng)絡(luò)分析。

    樣品要求

    詳情請聯(lián)系技術(shù)經(jīng)理。

    項目案列

    蛋白組和代謝組的差異統(tǒng)計結(jié)果柱狀圖

    蛋白組(A)和代謝組(B)的差異分析火山圖

    差異蛋白與差異代謝物表達(dá)相關(guān)性熱圖

    蛋白與代謝物的共表達(dá)關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖

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